Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UPP2O95045 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms