Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF10O60809 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRAMEF10O60809 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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