Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB3O43889 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREB3O43889 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms