Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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