Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HECTD4Q9Y4D8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms