Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRIT1Q9P2V4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LRIT1Q9P2V4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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