Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MMP26Q9NRE1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MMP26Q9NRE1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms