Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHST12Q9NRB3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms