Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN4Q9NQP4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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