Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZCCHC2Q9C0B9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms