Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms