Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC8Q9BY41 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms