Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC4A5Q9BY07 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms