Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SNHG12Q9BXW3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms