Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD3Q96L08 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms