Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms