Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms