Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXO38Q6PIJ6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXO38Q6PIJ6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms