Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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