Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC37Q16543 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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