Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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