Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEA2Q15560 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEA2Q15560 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCEA2Q15560 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms