Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
POLD3Q15054 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms