Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSPNQ14714 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSPNQ14714 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSPNQ14714 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSPNQ14714 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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