Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms