Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXF1Q12946 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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