Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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