Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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