Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms