Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSME1Q06323 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSME1Q06323 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms