Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CREMQ03060 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms