Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms