Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms