Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CTSSP25774 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CTSSP25774 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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CTSSP25774 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CTSSP25774 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CTSSP25774 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSSP25774 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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