Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDHBP21953 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHBP21953 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms