Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms