Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms