Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms