Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX3Q9UBR4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms