Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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