Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms