Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms