Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DDIT4Q9NX09 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DDIT4Q9NX09 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms