Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

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Length 1,244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ALPK1Q96QP1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ALPK1Q96QP1 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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