Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ZNF248Q8NDW4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF248Q8NDW4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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