Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GCSAMQ8N6F7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
GCSAMQ8N6F7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms