Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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