Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTLL9Q3SXZ7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTLL9Q3SXZ7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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