Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TWISTNBQ3B726 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TWISTNBQ3B726 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms