Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FSCN1Q16658 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms